13.01.2026 aktualisiert

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Biomedical Specialist

Basel, Schweiz
Weltweit
Doctor of Philosophy (PhD) in Medical Life Sciences and Technology
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Doctor of Philosophy (PhD) in Medical Life Sciences and Technology

Profilanlagen

Sophie Zengerle_CV_202601_english.pdf
ETH.pdf
SpinDiag_reference letter.pdf
240906 best poster certificate.pdf

Über mich

Biomedical researcher with expertise in patient-specific organoid disease modeling, single-cell and multiome sequencing, and advanced microscopy. Strong in project management, interdisciplinary collaboration, bioinformatics (R, Python), and leadership through team leading.

Skills

InnovationVerkaufsförderungMedizintechnikReinraumBildanalyseKonfokalSequenzierung des Gesamten GenomsGesundheitswissenschaftenPythonProjektmanagementMedical Science LiaisonMedical WritingWissenschaftskommunikationQualitative AnalyseStammzelle (Fachkompetenz)
Ich verfüge über ein breit gefächertes Kompetenzprofil, das tiefgehende experimentelle Expertise mit einem ausgeprägten Verständnis für datengetriebene biomedizinische Forschung verbindet. Im Rahmen meiner Promotion an der Technischen Universität München im Bereich patientenspezifischer Organoid-Krankheitsmodelle habe ich umfangreiche Erfahrung in der Planung, Durchführung und Koordination komplexer Forschungsprojekte gesammelt, von der wissenschaftlichen Konzeption über die experimentelle Umsetzung bis hin zur datenbasierten Analyse, Interpretation und zielgruppengerechten Kommunikation der Ergebnisse.

Mein akademischer Werdegang an der ETH Zürich in den Studiengängen Health Sciences and Technology sowie Biomedical Engineering vermittelte mir fundierte Einblicke in interdisziplinäre medizinische Fachbereiche, insbesondere Kardiologie, Knochenbiologie und Knorpelforschung. Diese Ausbildung ermöglichte mir, moderne in-vitro-Modelle in unterschiedlichen biologischen Kontexten anzuwenden und komplexe Fragestellungen aus verschiedenen fachlichen Perspektiven zu bearbeiten.

Technisch bringe ich umfassende Kenntnisse in der Arbeit mit iPSC-basierten Organoiden und patientenspezifischen Zellmodellen mit. Ein zentraler Schwerpunkt meiner Forschung liegt auf Single-Cell- und Multiome-Sequenzierungstechnologien (RNA + ATAC) zur Analyse zellulärer Heterogenität und regulatorischer Mechanismen. Die Auswertung hochdimensionaler Datensätze erfolgt mittels bioinformatischer Methoden und automatisierter Bildanalyse, wobei ich routiniert mit R, Python und ImageJ/Fiji arbeite. Ergänzend verfüge ich über Erfahrung in der Mikrofluidik, Reinraumtechniken sowie in fortgeschrittenen bildgebenden Verfahren wie Confocal-, Light-Sheet- und Tissue-Clearing-Mikroskopie.

Ein weiterer Schwerpunkt meiner Tätigkeit liegt in der interdisziplinären Zusammenarbeit an der Schnittstelle von Grundlagenforschung, Klinik und Industrie. Ich koordiniere nationale und internationale Forschungskooperationen, arbeite eng mit klinischen und externen Partnern zusammen und bringe ausgeprägte Projektmanagement-Kompetenzen in die strukturierte Planung, Umsetzung und Kommunikation wissenschaftlicher Projekte ein. Darüber hinaus übernehme ich Verantwortung in der Betreuung von Projektteams sowie in der Organisation wissenschaftlicher Austauschformate. Mein Ziel ist es, innovative biomedizinische Technologien und datenbasierte Ansätze in belastbare Erkenntnisse und anwendungsrelevante Lösungen zu überführen.



Sprachen

DeutschMutterspracheEnglischverhandlungssicherFranzösischgutSpanischGrundkenntnisse

Projekthistorie

Research Collaboration - lncRNAs in cardiac-specific isoform generation

Goethe University, Frankfurt
Performed gene knockdowns in cardiomyocytes to identify regulatory mechanisms of atrial-specific gene expression

PhD student - Patient-specific organoid disease modelling

TUM Universitätsklinikum, TU Munich
Independent management of PhD research project in Laboratory Regenerative Medicine for cardiovascular diseases, including experimental planning, coordination of timelines, presentation of regular progress updates

Research Collaboration - Lymphatic-epicardial crosstalk on cardiac development

Northwestern University, Chicago
Created automated image analysis algorithms that streamlined microscopy data processing and improved throughput

Master Thesis - Laboratory of Tissue Engineering and Biofabrication

ETH Zurich
Drug-induced rejuvenation of chondrogenitor cells using epigenetics and chemically induced hypoxia

Research Project - Laboratory of Bone Biomechanics

ETH Zurich
Controlled delivery of physiological mechanical stimuli into 3D osteocyte cultures

Working Student

Spindiag GmbH
Executed quality control assays for microfluidic disc validation and performance assurance

Internship

Biotechnology Start-Up Spindiag GmbH
Developed a temperature measurement assay for Peltier elements to ensure stable thermal conditions in automated microfluidic platforms

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